PCR完成後 ，建議將反應液於1000× g (大約4000 rpm) 離心1～3 min以沉澱血細胞碎片 ，之後取上清進行下遊分析 。該步驟可有效去除多種血液組分 。當使用高濃度血液模板時此步尤為重要 ，因為經過PCR循環 ，反應管中會存在大量的血細胞碎片 。這些碎片會幹擾下遊的檢測 ，如瓊脂糖電泳檢測 。注意 ：由於血液本身的原因 ，PCR 結束後在 PCR 管的底部會出現透明凝膠狀物質 ，此為正常現象。

對照反應

在PCR結果分析時 ，不管是陽性結果或陰性結果 ，如果沒有對照反應 ，都不能確定結果是否可靠 。為了便於後續實驗結果的分析 ，建議在進行PCR時 ，設置陽性和陰性PCR對照反應以便於排除假陽性或假陰性的幹擾 。

a）模板DNA ：選用樣本純化的DNA 。

b）引物的選擇 ：建議選擇該樣本較易擴增的基因的引物 ，如 β-actin 基因或 GAPDH 等 。

4.2 陰性對照

PCR反應體係被汙染會導致PCR結果出現假陽性 ，需要設置陰性對照來排除 。將使用的移液器槍頭浸泡在2× Blood Master Mix中 ，添加引物 ，ddH2O進行PCR擴增；另取ddH2O作為模板 ，用目的基因引物進行PCR擴增 ，以排除PCR體係是否被汙染和實驗是否有其他汙染源 。

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