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PCR檢測試劑盒中的引物應遵循哪些原則
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:707 更新時間
:2020-10-28
PCR檢測試劑盒參加PCR反應的物質主要有五種即引物
、酶
、dNTP
、模板和Mg2+
引物
:引物是PCR特異性反應的關鍵
,PCR 產物的特異性取決於引物與模板DNA互補的程度
。理論上
,隻要知道任何一段模板DNA序列
, 就能按其設計互補的寡核苷酸鏈做引物
,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴增
。設計引物應遵循以下原則
:
①引物長度
: 15-30bp
,常用為20bp左右
。
②引物擴增跨度
: 以200-500bp為宜
,特定條件下可擴增長至10kb的片段
。
③引物堿基
:G+C含量以40-60%為宜
,G+C太少擴增效果不佳
,G+C過多易出現非特異條帶
。ATGC隨機分布
,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列
。PCR檢測試劑盒
④避免引物內部出現二級結構
,避免兩條引物間互補
,特別是3'端的互補
,否則會形成引物二聚體
,產生非特異的擴增條帶
。
⑤引物3'端的堿基
,特別是末及倒數第二個堿基,應嚴格要求配對
,以避免因末端堿基不配對而導致PCR失敗
。
⑥引物中有或能加上合適的酶切位點
, 被擴增的靶序列*有適宜的酶切位點
, 這對酶切分析或分子克隆很有好處
。
⑦引物的特異性
:引物應與核酸序列數據庫的其它序列無明顯同源性
。
引物量
:每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol
,以引物量產生所需要的結果為好
,引物濃度偏高會引起錯配和非特異性擴增
,且可增加引物之間形成二聚體的機會
。PCR檢測試劑盒
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